很多年前，国外有位阿姨发现家里一直猫得耳朵不是立起来的，而是折下去的，意外的戳中了人们的萌点，于是给这只猫留下来后代，并且大量繁殖。为了保持这种折耳的样子，只能近亲繁殖，问题来了，这些猫咪很难长大，总是容易夭折，长大了寿命也不长，甚至畸形。
为什么会这样？
第一只苏格兰折耳猫是由于它的软骨基因发生了突变，导致耳朵立不起来，而这软骨基因控制的可不仅仅是耳朵的骨头，它控制的是全身！后续繁育的折耳猫天生存在遗传性骨骼病，即「软骨骨质化发育异常」（Osteochondrodysplasia），并且折耳不仅仅是耳朵的软骨跟普通猫不一样，身上的很多软骨组织都是有问题的。
虽然未必每只苏格兰折耳猫都会发病，但都存在一定的风险，发病年龄一般从两个月到六个月大不等，不过亦有病例是一岁以后才病发。已发病的猫咪，初期会表现得不爱活动其后行动会出现障碍，明显征状包括：
- 尾巴粗短、僵硬及不能屈曲，有些病猫的尾巴是不能摆动的。
- 后肢过短，有不寻常的弯曲、增生物或肿块。
- 四肢关节肿胀。
- 后脚掌异常肥厚，若细心观察，当猫咪坐直时，后脚掌的枕肉是触不到地面。
- 趾甲生长异常。
苏格兰折耳猫前肢也会出现类似征状但情度较后肢轻，不过这种遗传性骨骼病是没有办法根治，而且病情大多会不断恶化。目前兽医只能用药物舒缓病情，帮助猫咪减轻痛楚及减慢恶化速度，不过当病情恶化起来，骨骼病变的情况会慢慢蔓延至脊骨，令猫咪瘫痪并引致极大的痛楚。
苏格兰折耳猫常见疾病
呼吸系统毛病
骨骼病变的基因除影响手脚的骨骼外，亦会影响身体其它部份软骨组织发育异常。较常见的是呼吸管道收窄引起呼吸不畅顺，严重者需施以外科手术来扩阔呼吸管道。此外会有喷鼻血的问题，不过成因暂时未明和未有方法医治。
体质较弱
曾有病例，猫咪的体形及体重只有正常猫的三份之二，更曾感染猫瘟、皮肤病、过敏等毛病。
心脏病
心肌肥大症也是常见于苏格兰折耳猫身上，不过一般是很难发现，直到出现病征时，已有生命危险，猫咪需要控制饮食和终生服药。 作为主人的，看到猫咪受到不同程度的痛苦，心痛是必然的。
苏格兰折耳猫不是普遍有骨骼病变，而是100%有骨骼问题，只是严重程度不同。基于这个原因，出于人道主义，遗传学家建议取消折耳这一品种的繁育。有人质疑让它们消失就是为它们好吗？肯定的回答，是的，因为它们本不该出现，折耳这个基因本该被大自然淘汰，却因为人类独特的审美而大量繁殖，让痛苦伴随猫的一生。
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